Hola , no existe un proceso como tal (que yo conozca) que te ponga el inventario a 0 (ya que tiene que hacer un ajuste a los productos) tienes la opción de ir al diario de inventario y existe una opción que es calcular inventario físico , te creara líneas en el diario con la cantidad que tienes disponible actualmente , puedes poner la cantidad a 0 y cuando registres ya tendrías el inventario a 0.

Espero que te sirva.

Un saludo.