Hola Enric,

Si es posible. Nosotras de hecho tenemos instalado en un mismo servidor NAV2009R2, NAV2013, NAV2015, NAV2016, NAV2017 y ahora también NAV2018.
Hay un poco de interferencia entre ellos cuando haces un Run directamente desde el entorno de desarrollo. Pero este problema no te lo encontrarás si tu NAV2009R2 es en versión classic.

Un saludo,
Cristina Nicolàs