Para complementar un poco, el cliente web como lo menciona @Joker es el que se encentra en la nube y el de escritorio en un servidor, pero ahora con la versión de Business Central nos permite tener derechos de uso dual, permitiendo la opción de implementar el software en un servidor en la nube de Microsoft, hibrido y on-premises o local . Para mayor detalle puedes descargar la guía de licenciamiento de Business central para ver las diferentes posibilidades que ofrece este nueva plataforma.

Agrego link: https://dynamics.microsoft.com/es-es/business-central/overview/