Hola Roberto,

Efectivamente, la opción de seleccionar proyecto directamente en los pedidos solo está disponible en el área de compras, no en el área de ventas.
De hecho, en las ventas, tal y como funciona en módulo de proyectos, no es posible pasar por un pedido de venta, solo es posible emitir facturas de venta.
Y además, no se puede crear un documento de venta (en este caso una factura) y vincularla a un proyecto.
Lo que se tiene que hacer es crear la factura de venta desde el módulo de proyectos.
En el curso de proyectos se explican distintas maneras de facturar un proyecto, te dejo aquí los enlaces a las lecciones:

Lección 9. Facturar un Proyecto I
Lección 10. Facturar un Proyecto II
Lección 11. Facturar un Proyecto III

Un saludo,
Cristina Nicolàs