Hola Pilar,

No he tenido que lidiar nunca con esta casuística, los clientes que tengo que compran contra proyecto no utilizan las recepciones de almacén, sino que recepcionan desde el pedido de compra.

No te puedo decir si es seguro o no quitar ese filtro.

Pero hay otra casuística que no crea recepciones de almacén, es en las compras de subcontratación de fabricación.
No tiene nada que ver, pero en este caso también hay un filtro explícito en esta misma codeunit.
Yo seguí las indicaciones de este artículo: https://www.olofsimren.com/subcontracting-part-4-warehouse-receipts/ y me funcionó perfectamente.
Entre otros, quita precisamente ese filtro y permite que se creen las recepciones de almacén.

Quizá puedes aplicar algo similar a tu casuística. En cualquier caso, pruébalo bien antes no vaya a ser que con esto se rompa alguna otra funcionalidad.

Un saludo,
Cristina Nicolàs