Hola Carlos,
Diria que en las pruebas que he hecho, la factura proforma te imprime una factura con tipo Cuenta y con el importe de la factura proforma. Imagina que tienes indicado el 100% de Prepago.
Lo que hace es generar una factura proforma con el importe integro. Cuando el cliente te ha pagado entonces ya puedes crear el albarán.
Una vez acabado el proceso de servicio del albarán, entonces realizas la factura final. Esta será de importe 0 porque lo que hace es:
Crea todas las líneas de producto y después resta el importe que ha pagado el cliente.
No se si es a eso a lo que te refieres..
Saludos