Hola,

No he trabajado con los contactos demasiado, así que no te sé decir del cierto si puedes eliminar el contenido de estas tablas o no (aunque mi intuición me dice que si).
En cualquier caso, si que veo que en la configuración de Marketing hay una sección de configuración de los duplicados en donde podrías desmarcar que se busquen duplicados y que se mantengan estos strings de duplicados. Es posible que incluso desmarcando esto ya se eliminen estas tablas que comentas.

Un saludo,
Cristina Nicolàs