Hola Mar,
Aquí me has pillado. La verdad es que no te lo sé decir del cierto, pero siendo como es una configuración que se hace en la configuración de contabilidad, entiendo que sí, que aplica tanto a las compras como a las ventas. Pero en cualquier caso tendrías que hacer una prueba para confirmarlo.
Un saludo,
Cristina Nicolàs