Hola,
Si la factura la generaste desde la línea de planificación, en la factura registrada clicas la opción “Cancelar” y el abono registrado genera automáticamente la línea de planificación de abono. Esta la única manera de hacerlo para que lo haga automático.
Respecto a lo que comentas de que has creado el abono desde las líneas, es extraño, tendría que mirarlo para darte una respuesta.
Saludos